Bei Eintritt in die europäische Phase prüft das EPA als Bestimmungsamt, ob die Anmeldung, die in der Zwischenzeit vom Anmelder geändert worden sein kann, den Anforderungen an die Einheitlichkeit der Erfindung entspricht. Ist dies nicht der Fall, fordert die Prüfungsabteilung den Anmelder auf, die Anmeldung auf eine einzige Erfindung zu beschränken. Wurde aufgrund der Nicht
entrichtung zusätzlicher Recherchengebühren vom EPA nicht für alle in der Anmeldung enthaltenen Erfindungen eine Recherche durchgeführt, muss der Anmelder die Anmeldung auf die Erfindungen beschränken, die der ISR (oder der SISR) abdeckt (
vgl. 293). Da eine nicht recherchierte Erfindung in der europäischen Phase nur durch Einreichung einer Teilanmeldung weiterverfolgt werden kann, ist sehr sorgfältig abzuwägen, ob man in der internationalen Phase zusätzliche Gebühren entrichtet oder nicht (
vgl. 635).