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Pour des raisons liées au droit national, les cases figurant dans le cadre n° V du formulaire de requête PCT permettent à titre exceptionnel d'exclure de la désignation, qui est au demeurant automatique, l'Allemagne (DE), le Japon (JP) et la République de Corée (KR). Le fait de cocher la case correspondant à ces désignations équivaut non pas au retrait d'une désignation, mais à la non-désignation de l'Etat (des Etats) concerné(s).
Guide PCT de l'OMPI, 5.053
Conformément au droit national de ces Etats, le dépôt d'une demande internationale qui contient la désignation de cet Etat et revendique la priorité d'une demande nationale antérieure déposée dans cet Etat (en ce qui concerne l'Allemagne (DE), pour le même type de protection) a pour résultat que la demande nationale antérieure cesse de produire ses effets, avec les mêmes conséquences que le retrait de ladite demande nationale antérieure. Pour éviter cela, il faut cocher la case prévue à cet effet (cadre n° V du formulaire de requête du PCT). Pour plus d'informations sur l'"auto-désignation", il convient de s'adresser aux offices nationaux de brevets concernés.
Pour ce qui est des Etats parties à la CBE, le problème de l'auto-désignation concerne exclusivement l'Allemagne (DE), et ce uniquement si la requête PCT inclut la désignation automatique de l'Allemagne pour un brevet national. La désignation de l'Allemagne aux fins d'un brevet européen n'étant pas considérée comme une auto-désignation, elle n'est pas affectée. Il n'y a donc pas lieu de retirer la désignation automatique EP.
La législation nationale de certains Etats parties à la CBE prévoit qu'une demande PCT ne permet d'obtenir pour ces Etats qu'un brevet européen. Les pays qui interdisent à ces demandes d'emprunter la voie nationale étaient, au 1er octobre 2012, la Belgique (BE), Chypre (CY), la France (FR), la Grèce (GR), l'Irlande (IE), l'Italie (IT), la Lettonie (LV), Malte (MT), Monaco (MC), les Pays-Bas (NL) et la Slovénie (SI).